• Wednesday July 17,2019

Kaedah yang betul dan hasil palsu

Anonim

The Pith: Hasrat yang dihormati dan kepatuhan yang penuh dengan bentuk dan kaedah yang betul tidak menjamin satu set keputusan yang menghilangkan fenomena yang tulen. Kebanyakan sains adalah tragis.

Kebanyakan masa saya menunjuk dan mengkaji kertas kerja di weblog ini yang membangkitkan saya. Tetapi demi kepentingan "keseimbangan" dan kelembapan bias terhadap bahan, saya dapati menarik dan menonjol. Saya fikir ia akan menarik untuk melihat kertas yang saya fikir tidak terlalu menarik. Ia dalam Journal of Human Genetics, sebahagian daripada empayar Kumpulan Penerbitan Alam. Juga, ia adalah akses terbuka, jadi anda boleh membacanya sendiri dan membuat pertimbangan individu anda sendiri.

Soliga, suku terpencil dari India Selatan: kepelbagaian genetik dan afinitas filosofi:

Peranan India dalam penyebaran manusia moden dapat diterokai dengan menyiasat penduduk tertua: suku bangsa. Penduduk Soliga di Biligiri Rangana Hills, sebuah komuniti puak di India Selatan, boleh menjadi antara peneroka pertama di negara ini. Kumpulan ini, yang terikat dengan hutan, terikat dengan kehidupan yang terpencil, mengamalkan pertanian peringkat subsisten di bawah keadaan primitif. Tujuan kajian ini adalah untuk mengkaji hubungan filogenetik Soligas berhubung dengan 29 penduduk di seluruh dunia, disasarkan secara geografi, rujukan. Untuk tujuan ini, kami menggunakan bateri 15 buah locate repeat autosomal yang bersamaan dengan tanda penanda. Suku Soliga didapati sangat berbeza dari penduduk India yang lain termasuk puak Dravidian selatan yang lain. Sebaliknya, orang Soliga memperlihatkan hubungan genetik kepada dua penduduk asli Australia. Kesamaan genetik ini boleh dikaitkan dengan gelombang migrasi 'Keluar dari Afrika' di sepanjang pantai selatan India yang akhirnya sampai ke Australia. Selain itu, pertalian genetik yang diperhatikan boleh dijelaskan oleh migrasi yang lebih baru dari benua kecil India ke Australia.

Untuk menjadi tumpul mengenainya Saya fikir penyelidik di sini secara rawak tersandung pada hasil yang pelik yang berlaku untuk menyelaraskan dengan beberapa prasangka yang munasabah. Ini berlaku sepanjang masa, dan bertanggungjawab untuk bias pengesahan malang yang melanda sains. Para penyelidik tahu apa yang diharapkan, dan mungkin secara tidak sedar atau secara sedar mengejar data mereka untuk satu set fakta yang menyelaraskan dengan baik dengan prasangka teoretis mereka. Dalam hal ini ia tidak begitu besar, kerana tidak ada ortodoks, tetapi satu set hipotesis alternatif yang kembali satu abad atau lebih.


Cerita belakang adalah idea perlumbaan Australoid, yang pertama kali dipupuk oleh Thomas H. Huxely. Di sebelah kiri adalah peta yang menggambarkan bahagian asal manusia seperti yang disimpulkan oleh Huxley dari katalog watak manusia. Saya tidak menyertakan label kerana mereka seharusnya agak intuitif. Perhatikan teduhan Australia yang sama dan sebahagian India. Ini adalah sebagai ahli ekonomi mungkin mengatakan 'fakta yang bergaya, ' ia menangkap asas dasar kebenaran, tetapi seharusnya tidak diambil sebagai representasi konkrit ketat realiti. Hakikatnya adalah jelas bahawa apabila pemeriksaan visual banyak orang Asia Selatan, terutama yang disebut adivasi, penduduk "suku" yang lazimnya ada di pinggir atau di luar sistem kasta Hindu, mempunyai persamaan dengan Aborigin Australia. Selain itu, beberapa ahli anatomi menyatakan bahawa terdapat kesamaan dalam morfologi rangka dan sebagainya. Saya tidak dapat menilai itu, tetapi ada tradisi lama dalam antropologi biologi yang menegaskan bahawa ada hubungan antara orang-orang Australia dan elemen substrat di Asia Selatan. Ramai orang Asia Selatan yang saya tahu dapat melihat persamaan ini, jadi ia tidak seolah-olah "dicipta" oleh Thomas H. Huxley dari fikirannya yang subur.

Lebih baru-baru ini terdapat idea bahawa penghijrahan Keluar dari Afrika dicirikan oleh "gelombang selatan" yang memanjakan garis pantai lautan India, dan ditolak ke Australia. Sebab bahawa penghijrahan maritim yang cepat ini telah ditimbulkan adalah bahawa kediaman manusia moden di Australia sudah lama berdiri, atas perintah ~ 50, 000 tahun. Dalam model genetik tradisional kemunculan kemanusiaan moden yang meninggalkan hampir tidak ada waktu antara kebangkitan manusia moden di Afrika dan ketibaan mereka di Australia (sebaliknya, manusia moden secara anatom tidak sampai di Eropa hingga 40.000 tahun sebelum masa kini, dan mungkin sedikit kemudian). Jelas sekali penghijrahan manusia dari Afrika ke Australia akan terpaksa menyentuh asas di India. Oleh itu, ahli antropologi genetik mencari, khususnya mereka memberi tumpuan kepada keturunan kromosom mitokondria dan Y. Akhirnya mereka mendapati apa yang mereka cari. Pada frekuensi rendah di India, mereka mengesan kemungkinan sambungan ke haplogroup Australia. Dengan kata lain, nenek moyang orang Aborigin Australia yang tidak diragukan lagi di India meninggalkan beberapa keturunan di India.

Idea penghijrahan selatan neo-Afrika ~ 50, 000 tahun yang lalu secara semulajadi membenarkan seseorang untuk menjembatani model Huxley "bangsa Australoid" yang berasal dari taksonomi pra-kladistik kepada kaedah-kaedah genetik moden. Dan dengan mudah untuk tujuan kedalaman masa, ciri perlumbaan Australoid lebih jelas diwakili di kalangan penduduk kasta suku dan rendah yang juga dianggap mempunyai akar yang lebih mendalam di Asia Selatan.

Terdapat dua masalah besar yang melompat ke saya di sini walaupun. Yang pertama adalah agak teori: betapa tepatnya kesinambungan fenotip dapat dikekalkan antara populasi yang menyimpang ~ 50, 000 tahun yang lalu? Mengikut model yang lebih tua dari asal-usul manusia moden ini tidak benar-benar lebih lama daripada perbezaan umum yang terakhir antara semua orang bukan orang Afrika, dan mungkin juga orang Afrika. Adakah Orang Aborigin Australia dan populasi suku kaum India memasuki tempoh stasis fenotip? Ada yang menyeru di sini: hubungan antara populasi suku Indian dan Orang Asli Australia jauh lebih baru-baru ini. Hujah-hujah, tesis, dan data untuk menyokong ramalan ini semuanya dibentangkan di dalam kertas. Penganut yang paling melampaui telah mencadangkan bahawa sebenarnya penghijrahan berlaku ke Australia dalam tempoh ~ 5, 000 tahun yang lalu, yang membawa dingo itu, dan penghijrahan itu adalah sumber sumber umum Orang Aborigin Australia dan suku kaum India. Kedua-dua data genetik dan arkeologi adalah tendensius yang mungkin menyokong model ini. Perbincangan dalam teks kertas itu tidak masuk ke dalam perselisihan dan publisiti terus terang yang berlaku dalam teori-teori ini di Australia. Dan mengapa mereka perlu? Ini jurnal genetik manusia, bukan salah satu daripada pembinaan sosial sains. Tetapi penting untuk diingat.

Tetapi masalah besar adalah kerana mereka mencatat kajian beratus-ratus ribu SNP tidak menunjukkan hubungan antara Aborigin dan Asia Selatan yang sangat menyokong sebarang pertalian kuat antara kedua-dua kumpulan. Projek seperti Projek Ancestry Harappa mempunyai set data besar orang Asia Selatan, termasuk kaum India. Sekurang-kurangnya ada hubungan antara orang Papua dan Asia Selatan, tetapi ini cenderung untuk pergi ke K yang lebih tinggi. Saya fikir terdapat beberapa kesinambungan dan hubungan antara orang-orang Oceanians (Orang Asli Australia & Melanesians) dan substrat genetik Asia Selatan dan Tenggara, tetapi ia terlalu dilemahkan untuk membuktikan kegigihan kaum Australoid.

Jadi apa yang berlaku dengan hasil dalam kertas ini? Seperti yang saya perhatikan dalam tajuk kaedah itu adalah pada pendapat saya halal dari apa yang saya boleh katakan. Tetapi kesimpulannya justru tidak kelihatan dipuji. Bagaimana untuk menerangkan kegagalan kaedah yang sah? Pertama, mereka menggunakan 15 loci. Diberikan, ini adalah kawasan yang hypervariable dari genom yang harus informatif leluhur. Tetapi ia masih 15 penanda! Sangat penting penulis mencatatkan mengenai kaum India yang bergabung dengan Aborigine Australia:

Sebagai contoh, mereka mempunyai bilangan alel terendah (115) dari semua rujukan di seluruh dunia yang diperiksa.

Mereka juga memaparkan purata heterozygosity yang paling rendah (0.75643).

Tahap keseragaman genetik yang tinggi yang diperhatikan juga boleh disebabkan, sebahagiannya, oleh status rendah mereka dalam hierarki sosial.

Saya fikir penjelasan yang munasabah untuk homogenitas genetik mereka adalah seperti kebanyakan suku kaum India yang mempunyai saiz populasi yang rendah, dan begitu banyak kehilangan variasi genetik mereka kerana hanyut. Ambil 15 markah, engkongkan mereka melalui drift, dan saya tidak fikir ia tidak masuk akal bahawa anda boleh secara rawak berjalan populasi jauh dari jirannya. Populasi suku kaum India dalam analisis lain seolah-olah memperlihatkan corak yang berulang-ulang hasil yang aneh kerana pembiakan berlebihan atau sesetengah kesesakan populasi pada masa lalu (fikirkan tentang bagaimana Kalash dari Pakistan sering keluar dalam kelompok genetik mereka sendiri).

Ini membawa saya kembali kepada kecurigaan saya bahawa ini hanya positif palsu yang bubbled pada pertemuan model yang terdahulu dan bunyi bising yang akan menjadi isu dalam mana-mana analisis genetik statistik ini. Para penulis tahu bahawa suku kaum India harus berkumpul dengan Orang Asli Australia dalam beberapa model. Oleh itu, apabila mereka melihat salah satu dari beberapa populasi suku Indian mereka yang berkumpul dengan orang Aborigine pada diagnostik 15 mereka, secara semula jadi keputusan ini dimasukkan ke dalam model prefab. Tetapi seperti yang saya katakan sebelum ini jika anda "menggabungkan & menyamai" populasi dalam data anda, memodulasi ketebalan penanda, dan parameter tweak cukup, anda boleh "tersandung" apabila banyak model penjelasan menggunakan algoritma ini yang mendedahkan jarak genetik dan keturunan. Saya mengesyaki bahawa pasukan penyelidikan lain yang menggunakan populasi puak yang lain dengan STR lain mungkin telah tersandung pada hasil peninggalan, seperti kumpulan puak India dengan Sami atau Greenlanders, yang hanya dianggap sebagai tidak masuk akal di wajahnya. Hasilnya adalah jelas tidak masuk akal di muka, tetapi saya fikir melihat penyapuan penuh hasil genetik lain yang kita boleh membuangnya sebagai representasi yang baik dari jumlah hubungan genom antara kedua populasi ini. Satu iklan yang tidak masuk akal mengenai penekanan ini pada set penanda kecil adalah percubaan lama untuk membina perlumbaan berdasarkan pengedaran kumpulan darah!

Akhirnya, bagaimana pula dengan Thomas H. Huxley lama dan bangsa Australoidnya? Saya fikir ia mungkin evolusi konvergen. Manusia datang dalam pelbagai warna dari merah jambu hingga coklat yang sangat gelap. Mereka tidak datang merah atau kuning atau hijau. Mereka tinggi atau pendek. Rambut mereka keriting atau lurus. Dan sebagainya. Dalam kumpulan yang mungkin pembolehubah yang mungkin anda akan mempunyai banyak populasi manusia yang mencapai penumpuan ciri-ciri, dan begitu menyerupai satu sama lain walaupun kekurangan keturunan biasa yang baru-baru ini. Ainu dari Jepun pernah diasumsikan sebagai cawangan jauh dari keluarga orang Eropah kerana kekurangan ciri khas jiran Jepun mereka. Malah penanda genetik klasik awal mengalahkan saintis tentang kemungkinan ini, dan kerja genetik yang lebih baru seolah-olah menunjukkan hubungan yang besar dengan penduduk Siberia yang lain. Begitu juga, walaupun persamaan cetek antara orang Melanesia dan Afrika, kedua-dua kumpulan tidak begitu dekat (sebenarnya, kebanyakan langkah jarak genetik sepertinya meletakkan Melanesia lebih jauh dari orang Afrika daripada populasi Eurasia Barat, mungkin kerana pengasingan jangka panjang yang lebih besar).

Jenis-jenis komplikasi ini adalah mengapa saya begitu teragak-agak dengan menekankan dengan berhati-hati tentang bergantung pada angka tertentu atau kertas sebagai definitif pada soalan genetik yang diberikan. Dalam sesetengah keputusan domain boleh diambil dari konteksnya yang tepat, tetapi dalam kes sains statistik terdapat banyak perselisihan, dan persamaan intuitions yang hampir sama dengan pola dan jangkaan prasyarat kudus sangat menonjolkan kami untuk mengukuhkan keputusan. Inilah sebab utama mengapa saya sangat meremehkan dan bermusuhan dengan percubaan untuk "memenangi" hujah dengan menyeret beberapa petikan. Realiti sedih adalah bahawa kebanyakan keputusan adalah sama sepele atau palsu, dan dengan mesin pencari anda dapat membina argumen dengan lima fakta pendukung gaya sekolah rendah dalam beberapa minit.

Ini mungkin "menang" hujah, tetapi anda kehilangan perang untuk "memenangi" pemahaman realiti.

Tambahan: Pengambilan sampel populasi Aborigine Australia dan Asia Selatan dalam kaji selidik variasi genetik melembutkan kekuatan kritikan saya di sini. Mungkin Soglia adalah suku Dravidian tersendiri, yang memelihara unsur yang sangat kuno dalam sejarah genetik Asia Selatan. Secara jujur ​​saya agak ragu-ragu selepas melihat keputusan campuran yang berleluasa di kalangan semua warga Asia Selatan dalam gelombang kajian SNP-cip yang paling baru (termasuk amatur yang blogging genom). Masalah yang lebih besar bagi saya ialah pengambilan orang Aborigine Australia. Mungkin ada variasi yang kita tidak tahu. Saya ragu bahawa variasi itu akan terlalu mengejutkan, tetapi siapa tahu?

Citation: Morlote DM, Gayden T, Arvind P, Babu A, & Herrera RJ (2011). Soliga, suku terpencil dari India Selatan: kepelbagaian genetik dan afinitas filogenetik. Jurnal genetik manusia, 56 (4), 258-69 PMID: 21307856


Artikel Yang Menarik

Mercury Meletakkan Pameran Rare Isnin

Mercury Meletakkan Pameran Rare Isnin

Pada hari Isnin pagi, Mercury akan melepasi permukaan matahari - cermin yang berlaku hanya 13 atau 14 kali setiap abad. Bermula pada pukul 7:12 waktu Timur, planet terkecil sistem suria akan memulakan joging selama lebih kurang 7 jam di sebalik cakera matahari. Dengan peralatan tontonan yang betul, Mercury akan muncul sebagai titik peluncuran di seluruh muka matahari

Undang-undang Marijuana Perubatan Mengurangkan Kematian Lalu Lintas?  Tarik Kemahiran Pemikiran Kritikal Anda

Undang-undang Marijuana Perubatan Mengurangkan Kematian Lalu Lintas? Tarik Kemahiran Pemikiran Kritikal Anda

Jika anda mengingati apa-apa dari kelas statistik, ia mungkin bahawa korelasi tidak ada sebab. Hanya kerana dua nombor berlaku untuk naik pada masa yang sama tidak bermaksud bahawa seseorang itu menyebabkan yang lain naik (atau jatuh, atau tahan stabil, atau apa sahaja). Sekiranya tidak ada penjelasan yang munasabah tentang bagaimana kedua-duanya dapat disambungkan, dan bukti bahawa penjelasan itu memang penyebab, semua yang anda ada adalah beberapa baris pada carta

Sains Pocket - apabila bakteria yang diperbudak pergi buruk, mikrobiak usus dan tikus lemak, dan janggut besi yang meleleh

Sains Pocket - apabila bakteria yang diperbudak pergi buruk, mikrobiak usus dan tikus lemak, dan janggut besi yang meleleh

Percobaan Sains Psikologi Tidak Tepat diteruskan setelah majoriti orang yang berkomentar menyukai jawatan perintis. Saya benar-benar menikmati ini, kerana sebab-sebab yang agak tidak dijangka. Ia memaksa saya untuk melancarkan otot yang biasanya tidak mendapat banyak senaman. Menulis kepingan pendek bermakna jauh lebih ekonomik dengan bahasa dan terperinci daripada biasa

Forensik DNA Jejas Jerung Killed untuk Sirinya

Forensik DNA Jejas Jerung Killed untuk Sirinya

DISCOVER telah meliputi ahli sains menggunakan DNA untuk menyiasat penyeludupan gading di Afrika dan sama ada tuna biru yang terancam di sushi anda di New York City. Sekarang sebuah pasukan Amerika menggunakan taktik itu untuk mendapatkan jejak pasaran binatang lain yang dipersoalkan, jerung yang dibunuh untuk membuat sup sirip hiu di Asia