• Sunday July 21,2019

Siapakah mereka Gujus Houston?

Anonim

Angka di sebelah kiri adalah representasi tiga dimensi komponen utama 1, 2, dan 3, dihasilkan dari sampel Gujaratis dari Houston, dan Cina dari Denver. Apabila kedua-dua populasi ini dikumpulkan bersama, Cina membentuk kelompok yang sangat homogen. Mereka tidak banyak berubah di tiga dimensi penjelasan genetik. Sebaliknya, Gujaratis berbeza-beza. Ini tidak menghairankan. Dalam suplemen Membina semula sejarah penduduk India, adalah penting bahawa Gujaratis cenderung menyuarakan kepada dua kelompok yang berbeza dalam PCA. Inilah hasil yang anda lihat berulang kali apabila anda memanipulasi set data HapMap Gujarati. Pada hakikatnya, terdapat dua kluster yang sama. Sebaliknya, terdapat kumpulan "ketat" yang akan saya nyatakan "Gujarati_B" dari sekarang dalam set data saya, dan kumpulan lain, "Gujarati_A, " yang benar-benar hanya terdiri daripada semua individu yang berada di luar kelompok Gujarati_B. Malah jika dibandingkan dengan populasi Asia Selatan yang lain, dua kategori yang berbeza ini tetap di HapMap Gujaratis.

Zack telah mengenal pasti perbezaan utama antara kedua kelompok: Gujarat_A mempunyai beberapa individu yang mempunyai lebih banyak keturunan "Eurasia Barat". Untuk menjadi lebih formal mengenai hal ini pada masa akan datang, saya hanya menugaskan individu dalam kumpulan data gabungan saya ke salah satu dari dua kelompok Gujarati berdasarkan kedudukan mereka dalam dua PC pertama. Malam semalam saya berlari ADMIXTURE K = 2 hingga 10, dengan 75, 000 SNP. Saya juga mengeluarkan kumpulan asli Amerika, dan menambah lebih banyak sampel Eropah dan Timur Asia dari HapMap. Berikut adalah beberapa populasi di K = 4:


Mari kita gerakkan ke tahap individu. Berikut adalah individu Gujarati, bersama dengan Sindhis, dan ibu bapa saya (Bengali). Saya telah menyusun komponen "Eropah" dan kemudian "Asia Selatan" (biru dan hijau masing-masing, manakala ungu adalah modal dalam bahasa Papua dan merah di Asia Timur):

Plot ADMIXTURE adalah sejajar dengan PCA. Dalam PCA Gujarati_A mempamerkan spektrum jarak dari kluster Eropah, dan dalam ADMIXTURE anda melihatnya sama. Sebaliknya, Gujarati_B agak seragam. Jadi apa yang berlaku? Saya akan menghantar sesuatu yang serupa di Sepia Mutiny tidak lama lagi. Tetapi saya rasa bahawa Gujarati_B adalah sebahagian daripada Patels. Dalam erti kata lain, mereka adalah jati genetik yang berbeza. Saya mengesyaki bahawa Gujarati_A adalah kumpulan yang lebih pelbagai daripada beberapa jatis berbeza.

Adakah perkara ini? Saya percaya ia berlaku. Jika Gujarati_B adalah kumpulan etno-sosial yang berbeza yang merupakan subset dari Gujaratis, maka mereka mungkin tidak sebanding dengan proksi genetik perubatan Asia Selatan sebagai Gujarati_A. Secara lebih mendalam, Gujarati_B mungkin mempunyai alel penyakit jarang yang agak tinggi kerana mereka adalah puak inbred. Sebaliknya, sementara Gujarati_A boleh mempamerkan semua ciri endogamya Asia Selatan, jika mereka mempunyai bilangan kumpulan yang lebih besar, maka mereka akan mempunyai pelbagai alel yang berbeza. Yang mereka persekutukan mungkin lebih umum di Asia Selatan.


Artikel Yang Menarik

Talian Selari Tidak Pernah Salib, Malah di Jauh Amazonia

Talian Selari Tidak Pernah Salib, Malah di Jauh Amazonia

Berita apa: Orang dewasa dan anak usia sekolah mungkin memahami beberapa prinsip dasar geometri bahkan tanpa latihan matematik formal sama sekali, menurut sebuah kajian yang diterbitkan dalam talian semalam oleh Prosiding Akademi Sains Nasional . Tiga puluh orang anggota MundurucĂș, kumpulan pribumi Amazon, dapat memahami konsep geometri secara intuitif mengenai sudut, garis, dan titik, para penyelidik mendapati.

NCBI ROFL: Bahaya tersembunyi daripada dompet doktor.

NCBI ROFL: Bahaya tersembunyi daripada dompet doktor.

Doktor wanita 'dompet sebagai fomit yang tidak dikenali. "OBJEKTIF: Jangkitan berkaitan penjagaan kesihatan adalah masalah serius untuk komuniti perubatan hari ini. Secara amnya diandaikan bahawa pekerja penjagaan kesihatan bersentuhan dengan bakteria patologi dan secara tidak sengaja memindahkan mereka kepada pesakit sama ada secara langsung dengan tangan mereka, atau secara tidak langsung melalui beberapa benda mati

Nostalgia for Happy Times Mengurangkan Kemurungan pada Tikus

Nostalgia for Happy Times Mengurangkan Kemurungan pada Tikus

Ia adalah strategi mengatasi yang terkenal apabila anda berasa rendah untuk memikirkan kembali kenangan bahagia. Dan menurut kajian baru pada tikus, mengingat kenangan positif dapat melakukan lebih baik daripada yang kita pikir: ini dapat meningkatkan ketahanan jangka panjang untuk menekankan lebih efektif daripada sebenarnya mengalami peristiwa gembira baru

xkcd memancarkan

xkcd memancarkan

Randall Munroe, yang melancarkan webcomic geekerrific geekerrific, telah mencipta satu carta yang sangat baik yang memperlihatkan dos radiasi relatif yang diserap oleh manusia yang melakukan pelbagai aktiviti. Saya telah meletakkan sekepingnya di sini, bahagian dengan dos terendah. Saya suka ini! Ramai orang tidak memahami radiasi apa - sinaran adalah radiasi, contohnya - atau hanya dengan wujud di permukaan planet kita, anda menyerap jumlah tertentu sepanjang masa: dari tanah, dari ruang, dari benda yang anda makan

Lelaki Yang Mengetahui Musa Tetapi Bukan Anaknya Sendiri

Lelaki Yang Mengetahui Musa Tetapi Bukan Anaknya Sendiri

"Nissim", seorang lelaki berusia 64 tahun, tahu bahawa perkataan untuk anak sulung dalam keluarga adalah "anak sulung", tetapi dia mengatakan bahawa salji merah jambu dan kami memakai kot di kaki kami. Strok meninggalkannya tidak dapat bercakap tentang apa-apa kecuali konsep abstrak

Bolehkah Kita Cari Bumi Lain?

Bolehkah Kita Cari Bumi Lain?

Satu bintang seperti matahari yang hanya 19.5 tahun cahaya jauh yang boleh menampung planet seperti Bumi adalah Eta Cassiopeia, cahaya paling terang di langit swatch ini. Berdasarkan data fotografi yang diperolehi menggunakan Oschin Schmidt Telescope di Gunung Palomar. Survei Sky Observatory Palomar dibiayai oleh National Geographic Society