• Wednesday July 17,2019

Dunia adalah seperti yang sepatutnya dalam genomik peribadi

Anonim

Saya telah berseronok dengan genomik peribadi anak perempuan saya. Anda lihat, dia mempunyai seluruh keturunannya untuk r = 1/4. Jadi, sebagai contoh, sumbangan daripada datuk neneknya seolah-olah mengenai perintah ini:

Datuk datuk = 0.28
Nenek ayah = 0.22
Datuk ibu = 0.23
Nenek ibu = 0.27

Saya juga telah mengira bilangan rekombinan yang berlaku yang membawa kepada gamet yang menyerangnya. Ini akan menjadi jawatan masa depan. Tetapi di sini mari mengesahkan bahawa dia tidak dibuli. Saya menggunakan plink untuk ini. Inilah perihalan arahannya:

Memandangkan sebilangan besar SNP, dalam sampel homogen, adalah mungkin untuk mengira pekali pembiakbakaan (iaitu berdasarkan bilangan yang dijangkakan berbanding bilangan genotip homozigot).

.

Anggaran F kadang-kadang boleh negatif. Selalunya ini hanya akan mencerminkan kesilapan rawak rawak, tetapi hasil yang sangat negatif (iaitu individu yang mempunyai homozygote kurang daripada yang dijangkakan secara kebetulan di peringkat genom) boleh mencerminkan faktor lain, contohnya, kemungkinan kejadian pencemaran sampel.

Kekeliruan utama saya di sini ialah penduduk mana yang patut saya pilih? Sekiranya saya memilih GIH (HapMap Gujaratis?) Atau CEU (putih Utah)? Saya akhirnya menggunakan sampel TSI (Tuscans) sebagai kompromi palsu. Dan tentu saja, kerana dia bercampur-campur, hasilnya sangat negatif, kerana dia kurang homozygositi daripada "diharapkan" dari statistik penduduk yang luas. Saya juga menambah kawan inbred (ibu bapanya adalah sepupu pertama) sebagai "kawalan." Berikut adalah dua plot yang menunjukkan hasilnya.


F saya yang agak rendah tidak perlu mengejutkan. Asia Selatan mempamerkan tahap kepelbagaian genetik populasi yang agak tinggi sejauh orang-orang Eropah pergi. Tambahan pula, keturunan saya yang baru-baru ini adalah pelbagai. Saya mempunyai nenek moyang pelbagai latar belakang kasta, serta beberapa orang Asia Selatan. Tetapi anak perempuan saya pastinya lebih jelas. Walau bagaimanapun ambil perhatian bahawa kawan inbred saya lebih tinggi skala magnitud kesan. The Tuscans HapMap sudah dibesarkan, jadi ada lebih banyak ruang untuk "naik" daripada "ke bawah."


Artikel Yang Menarik

Manuver pada Beam Cahaya: Bagaimana Mengendali Pesawat Kapal Berlayar Solar

Manuver pada Beam Cahaya: Bagaimana Mengendali Pesawat Kapal Berlayar Solar

Musim panas ini, pelayaran matahari keemasan Jepun terbentang di angkasa, menjadi misi yang berjaya pertama untuk berlayar dengan tekanan fizikal sinaran matahari. Kejayaannya membawa para pemimpi seperti pengarah Persatuan Planetarium Bill Nye untuk membayangkan masa depan mesin yang diterajui oleh tekanan laser untuk meneroka kosmos

Adakah Sains Iklim Mempunyai John Scopes?

Adakah Sains Iklim Mempunyai John Scopes?

Dalam jawatan terakhir saya, saya menyatakan bahawa Los Alamitos Unified School District telah meletakkan dasar untuk "mengajar kontroversi" sains iklim. (Laporan berita di sini.) Jika ini adalah evolusi dan bukannya sains iklim, tindakan sedemikian mungkin menggambarkan Amaran Pertama, tuntutan gereja dan negeri

Friday Fluff - 26 November 2010

Friday Fluff - 26 November 2010

1. Pertama, satu jawatan dari masa lalu : Ketakwaan sosial manusia. 2. Pertanyaan carian pelik minggu ini : 'kajian biologi evolusi pelacur. ' 3. Komen minggu ini , sebagai tindak balas kepada kultus Korea: Razib, seperti yang anda katakan mereka celik, tetapi tidak dengan cara yang bebas

Buku (P) kajian # 1: Kehidupan Meningkat, Sepuluh Great Inventions Evolution

Buku (P) kajian # 1: Kehidupan Meningkat, Sepuluh Great Inventions Evolution

Bulan lalu, saya bertanya kepada anda bagaimana untuk mengendalikan timbunan buku sains yang saya terima (sebelum saya mendermakan kebanyakan mereka ke perpustakaan, sudah tentu). Banyak pluraliti yang anda undi memihak kepada penerangan kecil kerakyatan, dan bukannya alternatif seperti ulasan yang kurang kerap

Galaxy Orbit Betray Neatnik Universe

Galaxy Orbit Betray Neatnik Universe

Biasanya, kemajuan sains membawa kepada kerumitan yang lebih besar - sayangnya, Bumi bukan satu-satunya dunia; tidak, elektron tidak mempunyai bola kecil kecil; Malangnya, kuman tidak semua baik atau buruk. Tetapi sekali-sekala, para saintis menemui alam semesta yang suka pesanan kecil juga: Para astronom baru saja mengetahui gerombolan galaksi kerdil yang mengorbit yang besar cenderung melakukannya dalam cakera yang baik dan jelas

Starfish Meruntuhkan Eksperimen dan Mendedahkan Kekuatan Besar

Starfish Meruntuhkan Eksperimen dan Mendedahkan Kekuatan Besar

Para saintis sudah mengetahui bintang laut mempunyai kuasa-kuasa besar. Mereka boleh menjana keseluruhan anggota badan atau organ yang hilang; sesetengahnya boleh menyusun kembali seluruh badan dari satu tangan. Dan haiwan-haiwan ini baru saja mendedahkan kebolehan yang aneh. Kepada dua pelajar Denmark, ia pertama kali muncul sebagai kuasa untuk menghancurkan eksperimen